FISH assay development for the detection of <i>p16/CDKN2A</i> deletion in malignant pleural mesothelioma
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: To develop a fluorescence in-situ hybridisation (FISH) assay for detecting p16/CDKN2A deletion on paraffin tissue sections for use as an ancillary test to distinguish reactive from malignant mesothelial proliferations. METHOD: Dual-colour FISH for p16/CDKN2A and chromosome 9 (CEP-9) was performed on 11 benign mesothelial proliferations and 54 malignant pleural mesothelioma (MPM) cases to establish cut-off values for p16/CDKN2A deletion. A third MYC probe was used to verify cases showing homozygous deletion. Eight equivocal biopsies were used for assay testing. RESULTS: Cut-off values for p16/CDKN2A deletion were calculated based on FISH signalling patterns obtained from the benign controls (mean percent nuclei plus three standard deviations). Hemizygous deletion was defined as >44% of nuclei showing the hemizygous (one p16/CDKN2A, two CEP-9 signals) or >15% of nuclei showing the monosomy (one p16/CDKN2A, one CEP-9 signal) deletion patterns. None of the benign cases showed a homozygous deletion pattern (no p16/CDKN2A, at least one CEP-9 signal). In the malignant cases, the percentage of nuclei showing homozygous deletion ranged from 1% to 87%. Therefore, the cut-off value for homozygous deletion was defined as >10%. P16/CDKN2A deletion was detected in 61% (33/54) of MPM cases. Among the equivocal biopsies, four showed homozygous and one showed hemizygous p16/CDKN2A deletion. Age over 60 years, asbestos exposure and p16/CDKN2A deletion were associated with a worse prognosis. CONCLUSION: Distinction between benign and malignant mesothelial proliferations can be diagnostically challenging. FISH for p16/CDKN2A deletion is a useful test for confirming the diagnosis of MPM.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle