Looking beyond the DNA sequence: the relevance of DNA methylation processes for the stress–diathesis model of depression
Notice bibliographique
Résumé
The functioning of the hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis and serotonergic (5-HT) system are known to be intertwined with mood. Alterations in these systems are often associated with depression. However, neither are sufficient to cause depression in and of themselves. It is now becoming increasingly clear that the environment plays a crucial role, particularly, the perinatal environment. In this review, we posit that early environmental stress triggers a series of epigenetic mechanisms that adapt the genome and programme the HPA axis and 5-HT system for survival in a harsh environment. We focus on DNA methylation as it is the most stable epigenetic mark. Given that DNA methylation patterns are in large part set within the perinatal period, long-term gene expression programming by DNA methylation is especially vulnerable to environmental insults during this period. We discuss specific examples of genes in the 5-HT system (serotonin transporter) and HPA axis (glucocorticoid receptor and arginine vasopressin enhancer) whose DNA methylation state is associated with early life experience and may potentially lead to depression vulnerability. We conclude with a discussion on the relevance of studying epigenetic mechanisms in peripheral tissue as a proxy for those occurring in the human brain and suggest avenues for future research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».