Molecular detection of <i>Fusarium subglutinans</i> , the causal organism of internal fruit rot in greenhouse peppers
Notice bibliographique
Résumé
Internal fruit rot of sweet peppers, caused by Fusarium subglutinans is a new disease found in commercial greenhouses in British Columbia and Alberta, which causes considerable yield losses. Experiments were conducted to develop a rapid and accurate assay for detection of F. subglutinans, by dot-blot hybridization. Internal transcribed spacers 1 (ITS1) and 2 (ITS2) and 5.8S rDNA were amplified by polymerase chain reaction, using universal primers, and a dot-blot assay was employed to detect the pathogen in culture and in the host. Among six probes tested, three (Fsub-1, Fsub-3, and Fsub-5) were selected because they differentiated F. subglutinans from other Fusarium spp. and greenhouse pathogens. Probe Fsub-3 hybridized with all F. subglutinans isolates. Fsub-1 hybridized only with F. subglutinans isolates from Monterey pine (Pinus radiata). Fsub-5 hybridized with F. subglutinans isolates from corn (Zea mays), peppers (Capsicum annuum), and Panicum miliaceum, but not with Pinus radiata isolates. None of these primers hybridized with Fusarium spp. other than F. subglutinans or with other pathogens of greenhouse crops. Dot-blot hybridization developed in this study differentiates F. subglutinans from other Fusarium spp. as well as from other fungal pathogens causing fruit rot of peppers. This technique may help to detect and identify F. subglutinans in culture and in pepper fruits.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».