Simultaneous Quantification of Epstein-Barr Virus, Cytomegalovirus, and Human Herpesvirus 6 DNA in Samples from Transplant Recipients by Multiplex Real-Time PCR Assay
Notice bibliographique
Résumé
We developed a multiplex real-time PCR assay using 6-carboxyfluorescein, 6-carboxy-4',5'-dichloro-2',7'-dimethoxyfluorescein, and carbocyanine 5-labeled probes to simultaneously quantify Epstein-Barr virus (EBV), cytomegalovirus (CMV), and human herpesvirus 6 (HHV-6) DNA. When previously tested and stored DNA samples were examined, results of the multiplex real-time PCR assay were as sensitive and specific as those of a single real-time PCR assay. The multiplex assay was used to quantify the EBV, CMV, and HHV-6 DNA in 46 transplant recipients. A total of 303 whole-blood and plasma specimens were collected and analyzed. According to the results of the multiplex assay, the detection rates for viral DNA in whole blood and plasma were 23.8% and 5.9% for EBV, 11.2% and 5.3% for CMV, and 12.5% and 2.0% for HHV-6, respectively. All forms of viral DNA were detected more frequently in whole blood than in plasma. During the symptomatic period, EBV DNA was detected in all whole-blood specimens but not in all plasma specimens. Furthermore, the EBV DNA load in whole blood was higher during the symptomatic period than during the asymptomatic period, whereas the EBV DNA load in plasma was similar for both periods. These results demonstrate that whole blood is more suitable for the quantification of EBV DNA in transplant patients. However, a cutoff value with clinical relevance still needs to be determined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».