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Enregistrement W2165460976 · doi:10.6000/1927-7229.2012.01.02.3

Comparison of APTIMA HPV E6/E7 mRNA and Hybrid Capture 2 Assays using Wet and Dry Self-Collected Flocked Vaginal Swabs and PreservCyt L-Pap Samples

2012· article· en· W2165460976 sur OpenAlexaffvenue
Larry Lawson, Alice Lytwyn, D. Jang, Michelle Howard, Laurie Elit, K. Onuma, Michelle Klingel, R. Toor, Jodi Gilchrist, A. Ecobichon-Morris, Marek Smieja, Max Chernesky

Notice bibliographique

RevueJournal of Analytical Oncology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHybrid captureColposcopyGynecologyInternal medicineCervical cancerCancerCervical intraepithelial neoplasia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Performance of HPV assays on less invasive specimens can be assessed through agreement of assays and specimen types as well as the ability to identify patients with precancerous lesions. Objectives: To compare the APTIMA HPV (AHPV) E6/E7 mRNA assay to the HC2 DNA test for high risk (HR) HPV performed on PreservCyt L-Pap cervical specimens and flocked self-collected vaginal swabs (SCVS) transported to the laboratory wet or dry. Results: Testing specimens from 100 women attending a colposcopy clinic showed 90.7% (k=0.81) agreement between HC2 and AHPV assays for PreservCyt specimens. Agreement was 80.2% (K=0.80) to 88.0% (K=0.76) between L-Pap and wet and dry SCVS respectively and 89.2% (K=0.77) between the 2 SCVS by AHPV testing. For HC2, the agreement was 90.6% (k=0.81) to 89.2% (k=0.78) between L-Pap and the 2 swabs and 96.0% (k=0.90) between wet and dry swabs. Using pathology (CIN2+) as the reference standard, SCVS tested by AHPV demonstrated sensitivities of 88.8% for dry and 90% for wet SCVS, compared to 86.4% for L-Pap samples. HC2 testing of wet and dry SCVS was 70.8% sensitive compared to 94.4% for L-Pap samples. Conclusion: SCVS collected with flocked nylon swabs transported wet or dry may serve as alternative specimens for HPV testing of women who are reluctant to have a pelvic examination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,716

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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