Nested analysis of genetic diversity in northwestern North American char, Dolly Varden (<i>Salvelinus malma</i>) and bull trout (<i>Salvelinus confluentus</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Partitioning within-species genetic diversity is fundamental to conservation of the bioheritage, current viability, and evolutionary potential of individual taxa. We conducted a hierarchical analysis of genetic diversity in Dolly Varden (Salvelinus malma) and bull trout (Salvelinus confluentus) involving analysis of hybrid zones between Dolly Varden and bull trout, analysis of phylogenetic structure within species across their native ranges using mitochondrial DNA, and a microsatellite DNA survey of population subdivision of bull trout within single watersheds. Our analyses documented hybridization and some introgression between Dolly Varden and bull trout across a geographically widespread zone of secondary contact between the two species. Both species were subdivided into two major mtDNA lineages, and one lineage in Dolly Varden may have arisen through introgression with bull trout. Bull trout have low levels of microsatellite diversity within populations, but there was substantial interpopulation variation in allele frequencies. Allele frequency distributions suggested that recent, severe bottlenecks occur frequently in bull trout populations. Our results illustrate partitioning of genetic variation at distinct levels of biological organization (species, phylogeographic lineages, local populations), and we address how such nested variation is fundamental to conservation of biodiversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».