MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2165595211 · doi:10.1128/aem.67.2.569-574.2001

Identification of Bacteriocin-Like Inhibitors from Rumen <i>Streptococcus</i> spp. and Isolation and Characterization of Bovicin 255

2001· article· en· W2165595211 sur OpenAlexaff
M F Whitford, Margaret A. McPherson, Robert J. Forster, R. M. Teather

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of LethbridgeLethbridge CollegeAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmmonium sulfate precipitationBacteriocinBiologyMicrobiologyStreptococcus bovisBacteriaStreptococcus dysgalactiaeBiochemistryPeptideGel electrophoresisAntibacterial activityNisinStreptococcus agalactiaeStreptococcusRumenSize-exclusion chromatographyFermentationAntimicrobialEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptococci obtained from rumen sources were tested for the production of antibacterial compounds using a deferred-antagonism plating assay. Of 35 isolates tested, 7 were identified that inhibited the growth of other streptococci. None of the inhibitory activity was due to bacteriophage. Three isolates, LRC0253, LRC0255, and LRC0476, were selected for further characterization. Analysis of 16S ribosomal DNA indicated that LRC0476 was a strain of Streptococcus bovis, while isolates LRC0253 and LRC0255 are likely strains of Streptococcus gallolyticus. The antibacterial compounds produced by these bacteria were protease sensitive, remained active in a pH range from 1 to 12, and did not lose activity after heating at 100 degrees C for 15 min. The inhibitory peptide from strain LRC0255 was purified using pH-dependent adsorption and desorption to bacterial cells, followed by ammonium sulfate precipitation and reversed-phase chromatography and gel filtration. The peptide was 6 kDa, as determined by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis. An oligonucleotide probe based on the N-terminal sequence of the purified peptide was used to identify the gene encoding the inhibitory peptide. The antibacterial peptide has characteristics that are very similar to those described for class II bacteriocins of gram-positive bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,153
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied and Environmental MicrobiologyMême sujetProbiotics and Fermented FoodsTravaux en français237 207