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Enregistrement W2165607897 · doi:10.1099/mic.0.26154-0

rhlA is required for the production of a novel biosurfactant promoting swarming motility in Pseudomonas aeruginosa: 3-(3-hydroxyalkanoyloxy)alkanoic acids (HAAs), the precursors of rhamnolipids

2003· article· en· W2165607897 sur OpenAlexaff
Éric Déziel, François Lépine, Sylvain Milot, Richard Villemur

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRhamnolipidSwarming motilityChemistryRhamnosePseudomonas aeruginosaOperonExtracellularMutantSwarming (honey bee)MicrobiologyMotilityBiosynthesisOverproductionBiochemistryBacteriaBiologyEnzymeCell biologyGeneVirulenceQuorum sensingGalactoseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa produces extracellular glycolipids composed of L-rhamnose and 3-hydroxyalkanoic acid called rhamnolipids. Although these compounds are usually regarded as biosurfactants or haemolysins, their exact physiological function is not well understood. Rhamnolipids are synthesized by a rhamnosyltransferase, encoded by the rhlAB operon, which catalyses the transfer of TDP-L-rhamnose to 3-(3-hydroxyalkanoyloxy)alkanoic acid (HAA) moieties of various lengths. RhlB is the catalytic protein of the rhamnosyltransferase. rhlA is indispensable for rhamnolipid synthesis, but its function is unknown. Using a liquid chromatography/mass spectrometry method, the production of extracellular HAAs by P. aeruginosa was detected previously and it was demonstrated that they are the actual precursors of rhamnolipid biosynthesis. In this report, evidence is presented indicating that rhlA is required for production of HAAs and that these HAAs display potent surface-active properties. P. aeruginosa can colonize surfaces by swarming motility, a form of organized translocation requiring the production of wetting agents. Using rhlA and rhlB mutants it was observed that swarming requires the expression of the rhlA gene but does not necessitate rhamnolipid production, as HAAs act as surfactants. Finally, it was shown that the use of ammonium instead of nitrate as source of nitrogen and an excess of available iron both decrease rhlA expression and swarming motility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations498
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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