A variant OSR1 allele which disturbs OSR1 mRNA expression in renal progenitor cells is associated with reduction of newborn kidney size and function
Notice bibliographique
Résumé
Human nephrons are formed during fetal life through an interaction between the branching ureteric bud and progenitor cells. The wide variation in final nephron number has been attributed to allelic variants of genes regulating ureteric bud arborization. Here, we hypothesize that dysfunctional variants of the Odd-Skipped Related 1 (OSR1) gene which compromise the renal progenitor cell pool might also limit newborn kidney size and function. We show that OSR1 is expressed in human mesenchymal stem cells, the blastemal component of Wilms tumors and CD24+/CD133+ progenitor cells isolated from the mature kidney. We identified an OSR1(rs12329305(T)) allele in 6% of normal Caucasians which alters an exon2 splice enhancer. This variant is predicted to reduce spliceosome-binding affinity and stability of the OSR1 mRNA. In cultured cells, the OSR1(rs12329305)(T) allele produced no identifiable transcript. Normal Caucasian newborns from Montreal with the OSR1(rs12329305)(T) allele had kidney volume 11.8% smaller (P= 0.006) and cord blood cystatin C levels 12.6% higher (P = 0.005) than those with wild-type genotype. Effects of the OSR1(rs12329305)(T) allele are additive with genes that alter ureteric bud branching. Kidney volume was reduced more in newborns bearing both RET(rs1800860)(A) and OSR1(rs12329305)(T) alleles (22%, P= 0.0008) and cystatin C was increased by 17% (P= 0.006) versus newborns with wild-type alleles. Although only two subjects had PAX2(rs11599825)(A) and OSR1(rs12329305)(T) alleles, kidney size was reduced by 27% and cystatin C was increased by 14% versus wild-types (P= NS).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».