MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2165660929 · doi:10.1128/iai.72.9.5115-5125.2004

SseK1 and SseK2 Are Novel Translocated Proteins of<i>Salmonella enterica</i>Serovar Typhimurium

2004· article· en· W2165660929 sur OpenAlexaff
Sonya L. Kujat Choy, Erin C. Boyle, Ohad Gal‐Mor, David L. Goode, Yanet Valdez, Bruce A. Vallance, B. Brett Finlay

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySalmonella entericaVirulenceMicrobiologySecretionEffectorType three secretion systemSalmonellaPathogenicity islandChromosomal translocationIntracellular parasiteEnterobacteriaceaePathogenMutantEscherichia coliBacteriaIntracellularCell biologyBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmonella enterica is a gram-negative, facultative intracellular pathogen that causes disease symptoms ranging from gastroenteritis to typhoid fever. A key virulence strategy is the translocation of bacterial effector proteins into the host cell, mediated by the type III secretion systems (TTSSs) encoded in Salmonella pathogenicity island 1 (SPI-1) and SPI-2. In S. enterica serovar Typhimurium LT2, we identified the protein products of STM4157 and STM2137 as novel candidate secreted proteins by comparison to known secreted proteins from enterohemorrhagic Escherichia coli and Citrobacter rodentium. The STM4157 and STM2137 proteins, which we have designated SseK1 and SseK2, respectively, are 61% identical at the amino acid level and differ mainly in their N termini. Western analysis showed that in vitro accumulation and secretion of these proteins in serovar Typhimurium were affected by mutations in the two-component systems SsrA/B and PhoP/Q, which are key mediators of intracellular growth and survival. SPI-2 TTSS-dependent translocation of recombinant SseK1::Cya was evident at 9 h postinfection of epithelial cells, while translocation of SseK2::Cya was not detected until 21 h. Remarkably, the translocation signal for SseK1 was contained within the N-terminal 32 amino acids. Fractionation of infected epithelial cells revealed that following translocation SseK1 localizes to the host cytosol, which is unusual among the currently known Salmonella effectors. Phenotypic analysis of DeltasseK1, DeltasseK2, and DeltasseK1/DeltasseK2 mutants provided evidence for a role that was not critical during systemic infection. In summary, this work demonstrates that SseK1 and SseK2 are novel translocated proteins of serovar Typhimurium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,867
Score d'incertitude au seuil0,564

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInfection and ImmunityMême sujetSalmonella and Campylobacter epidemiologyTravaux en français237 207