Use of immunohistochemical markers can refine prognosis in triple negative breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Basal-like breast cancer has been extensively characterized on the basis of gene expression profiles, but it is becoming increasingly common for these tumors to be defined on the basis of immunohistochemical (IHC) staining patterns, particularly in retrospective studies where material for expression profiling may not be available. The IHC pattern that best defines basal-like tumors is under investigation and various combinations of ER, PR, HER2-, CK5/6+ and EGFR+ have been tested. METHODS: Using datasets from two different hospitals we describe how using different combinations of immunohistochemical patterns has different effects on estimating prognosis at different time intervals after diagnosis. As our baseline, we used two IHC patterns ER-/PR-/HER2-("triple negative phenotype", TNP) and ER-/HER2-/CK5/6+ and/or EGFR+ ("core basal phenotype", CBP). RESULTS: There was no overall difference in survival between the two hospital-based series, but there was a difference between the TNP and non-TNP groups which was most marked at 3 years (76.8% vs 93.5%, p < .0001). This difference reduced with time, suggesting that long term survivors (beyond 10 years) in the TNP group may have comparable survival to non-TNP cases. A similar difference was seen if CBP was used instead of TNP. However when CK5/6 and/or EGFR expressing tumors were analyzed without consideration of ER/PR status, the reduction in survival increased with time, becoming more pronounced at 10 years than at 3 years. CONCLUSION: Our findings suggests that CK5/6 and/or EGFR expressing tumor types have a persistently poorer prognosis over the longer term, an observation that may have important therapeutic implications as drugs that target the EGFR are currently being evaluated in breast cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».