Expression and regulation of prostate androgen regulated transcript-1 (PART-1) and identification of differential expression in prostatic cancer
Notice bibliographique
Résumé
Prostate androgen regulated transcript 1 (PART-1), is a gene predominantly expressed in the prostate gland and is regulated by androgens in human prostate cancer cell lines. Here, we report additional characteristics of PART-1 tissue expression and hormonal regulation and study its expression profile in human normal and matched prostate cancer tissues. Since PART-1 shows similarity to prostate-specific antigen (PSA) in prostate specificity and regulation, we hypothesized that it may be implicated in prostate carcinogenesis or may be a potential new biomarker. We used reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) to further characterize PART-1 tissue expression and hormonal regulation in the LNCaP prostate cancer cell line. RT-PCR analysis revealed that PART-1 is expressed not only in the prostate and salivary gland, but also in other tissues, including the thymus and placenta. In addition to androgen stimulation, PART-1 is also up-regulated by progestins, oestrogens and glucocorticoids. We further studied the expression of PART-1 in 27 paired (from the same patient) cancerous and non-cancerous prostatic tissues, with qualitative and quantitative RT-PCR (LightCycler technology), in order to examine whether PART-1 is overexpressed or underexpressed in cancer. Our results indicated that PART-1 is more frequently overexpressed in the cancerous prostatic tissue. We conclude that this gene is overexpressed in prostate cancer and may represent a novel prostate cancer tumour marker.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».