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Enregistrement W2165800754 · doi:10.1111/cge.12654

Utility of whole‐exome sequencing for those near the end of the diagnostic odyssey: time to address gaps in care

2015· review· en· W2165800754 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMcMaster UniversityIzaak Walton Killam Health CentreUniversity of AlbertaMcGill Genome CentreBC Children's HospitalUniversity of British ColumbiaChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaManitoba HealthOttawa HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineSickKids FoundationUniversité de MontréalWestern UniversityHospital for Sick ChildrenMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversity of TorontoMemorial University of NewfoundlandMontreal Neurological Institute and HospitalAlberta Children's HospitalUniversity of OttawaMcGill UniversityMcGill University Health CentreNorth York General HospitalUniversity of CalgaryHealth Sciences CentreUniversity of Alberta HospitalMontreal Children's HospitalMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsUniversity of TorontoGenome British ColumbiaGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsOntario Genomics Institute
Mots-clésExome sequencingExomeGeneticsMedicineComputational biologyBiologyBioinformaticsMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An accurate diagnosis is an integral component of patient care for children with rare genetic disease. Recent advances in sequencing, in particular whole-exome sequencing (WES), are identifying the genetic basis of disease for 25-40% of patients. The diagnostic rate is probably influenced by when in the diagnostic process WES is used. The Finding Of Rare Disease GEnes (FORGE) Canada project was a nation-wide effort to identify mutations for childhood-onset disorders using WES. Most children enrolled in the FORGE project were toward the end of the diagnostic odyssey. The two primary outcomes of FORGE were novel gene discovery and the identification of mutations in genes known to cause disease. In the latter instance, WES identified mutations in known disease genes for 105 of 362 families studied (29%), thereby informing the impact of WES in the setting of the diagnostic odyssey. Our analysis of this dataset showed that these known disease genes were not identified prior to WES enrollment for two key reasons: genetic heterogeneity associated with a clinical diagnosis and atypical presentation of known, clinically recognized diseases. What is becoming increasingly clear is that WES will be paradigm altering for patients and families with rare genetic diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil0,664

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle