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Enregistrement W2165825824 · doi:10.1128/jb.186.20.6824-6829.2004

Replicon-Specific Regulation of Small Heat Shock Genes in <i>Agrobacterium tumefaciens</i>

2004· article· en· W2165825824 sur OpenAlexafffund
Sylvia Balsiger, Curdin Ragaz, Christian Baron, Franz Narberhaus

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyAgrobacterium tumefaciensRepliconGeneGeneticsHeat shock proteinAgrobacteriumPlasmidTransformation (genetics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Four genes coding for small heat shock proteins (sHsps) were identified in the genome sequence of Agrobacterium tumefaciens, one on the circular chromosome (hspC), one on the linear chromosome (hspL), and two on the pAT plasmid (hspAT1 and hspAT2). Induction of sHsps at elevated temperatures was revealed by immunoblot analyses. Primer extension experiments and translational lacZ fusions demonstrated that expression of the pAT-derived genes and hspL is controlled by temperature in a regulon-specific manner. While the sHsp gene on the linear chromosome turned out to be regulated by RpoH (sigma32), both copies on pAT were under the control of highly conserved ROSE (named for repression of heat shock gene expression) sequences in their 5' untranslated region. Secondary structure predictions of the corresponding mRNA strongly suggest that it represses translation at low temperatures by masking the Shine-Dalgarno sequence. The hspC gene was barely expressed (if at all) and not temperature responsive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,441

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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