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Enregistrement W2165833212 · doi:10.1086/649213

Health Care–Associated<i>Clostridium difficile</i>Infection in Canada: Patient Age and Infecting Strain Type Are Highly Predictive of Severe Outcome and Mortality

2009· article· en· W2165833212 sur OpenAlexaffabout
Mark A. Miller, Denise Gravel, Michael R. Mulvey, Geoffrey Taylor, David A. Boyd, Andrew E. Simor, Michael Gardam, Allison McGeer, James Hutchinson, Dorothy Moore, Sharon Kelly

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensMontreal Children's HospitalUniversity Health NetworkPublic Health Agency of CanadaUniversity of Alberta HospitalSt. John’s Health Sciences CentreMount Sinai HospitalHealth Sciences CentreAlberta Hospital EdmontonMcGill University Health CentreSunnybrook Health Science CentreJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineClostridium difficileIntensive care unitIncidence (geometry)PopulationColectomyInternal medicineInfection controlStrain (injury)PediatricsDiseaseIntensive care medicineMicrobiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: C. difficile infection (CDI) has become an important and frequent nosocomial infection, often resulting in severe morbidity or death. Severe CDI is more frequently seen among individuals infected with the emerging NAP1/027/BI (NAP1) strain and in the elderly population, but the relative importance of these 2 factors remains unclear. We used a large Canadian database of patients with CDI to explore the interaction between these 2 variables. METHODS: The Canada-wide CDI study, performed in 2005 by the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program (CNISP), was used to analyze the role of infecting strain type and patient age on the severity of CDI. A severe outcome was defined as CDI requiring intensive care unit care, colectomy, or causing death (directly or indirectly) within 30 days after diagnosis. RESULTS: A total of 1008 patients in the CNISP database had both complete clinical data and infecting strain analysis documented. A total of 311 patients (31%) were infected with the NAP1 strain, 83 (28%) were infected with the NAP2/J strain, and the rest were infected with various other types. The proportion of NAP1 infections correlated with the incidence and the severity of CDI when analyzed by province. Thirty-nine (12.5%) of the infections due to the NAP1 strain resulted in a severe outcome, compared with only 41 (5.9%) of infections due to the other types (P < .001). The patient's age was strongly associated with a severe outcome, and patients 60-90 years of age were approximately twice as likely to experience a severe outcome if the infection was due to NAP1, compared with infections due to other types. CONCLUSIONS: Our study confirms the strong age association with infection due to the NAP1 strain and severe CDI. In addition, patients 60-90 years of age infected with NAP1 are approximately twice as likely to die or to experience a severe CDI-related outcome, compared with those with non-NAP1 infections. Patients >90 years of age experience high rates of severe CDI, regardless of strain type.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,079

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations282
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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