Amino acid sequences within the β1 domain of human apolipoprotein B can mediate rapid intracellular degradation
Notice bibliographique
Résumé
Apolipoprotein B (apoB)-48 contains a region termed the beta1 domain that is predicted to be composed of extensive amphipathic beta-strands. Analysis of truncated apoB variants revealed that sequences between the carboxyl termini of apoB-37 and apoB-42 governed the secretion efficiency and intracellular stability of apoB. Although apoB-37, apoB-34, and apoB-29 were stable and secreted efficiently, apoB-42 and apoB-100 were secreted poorly and were degraded by an acetyl-leucyl-leucyl-norleucinal (ALLN)-sensitive pathway. Amino acid sequence analysis suggested that a segment between the carboxyl termini of apoB-38 and apoB-42 was 63% homologous to fatty acid binding proteins (FABPs), which contain orthogonal beta-sheets. To test the hypothesis that sequences from the beta1 domain are involved in apoB degradation, fusion proteins were created that contained apoB-29 linked to fragments derived from the beta1 domain of apoB or to liver FABP. Fusion proteins containing the beta1 domain segments apoB-34-42 or apoB-37-42 were degraded rapidly, whereas other fusion proteins were stable and secreted efficiently. Degradation was ALLN-sensitive, and the apoB-34-42 segment increased the association of the apoB protein with the cytosolic surface of the microsomal membrane. Our data suggest that the presence of specific sequences in the beta1 domain of human apoB increases degradation by promoting the cytosolic exposure of the protein, although not all regions of the beta1 domain are functionally equivalent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».