Construction and Characterization of Single-Chain Variable Fragment Antibodies Directed against the <i>Bordetella pertussis</i> Surface Adhesins Filamentous Hemagglutinin and Pertactin
Notice bibliographique
Résumé
A single-chain variable fragment (scFv) antibody library against Bordetella pertussis was constructed using M13 phage display. The library was enriched for phages surface displaying functional scFv by biopanning against B. pertussis immobilized on polystyrene plates. Two hundred eighty-eight individual clones from the enriched library were screened for binding to B. pertussis cells, filamentous hemagglutinin (FHA), and pertactin (PRN) in enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs). Based on the binding ability, the clones were put into eight groups. The scFv DNA inserts from the 288 clones were digested with BstOI, and 18 unique restriction patterns, named types 1 to 18, were found. Eight clones (types 1 to 7 and 18) were selected for further testing against FHA, PRN, and B. pertussis by ELISA. The results showed that types 1, 5, 7, and 18 bound strongly to B. pertussis cells as well as FHA and PRN. Type 3 bound strongly to the cells and FHA but weakly to PRN. Types 4 and 6 bound FHA only, and type 2 did not bind to the cells or antigens. The ability of the eight clones to inhibit B. pertussis from binding to HEp-2 cells was assayed. Types 1, 5, and 7, but not the remaining clones, inhibited the adherence of B. pertussis to HEp-2 cells. The scFvs were sequenced, and the deduced amino acid sequence showed that the scFvs were different antibodies. Maltose-binding protein (MBP) fusion proteins composed of three different regions of FHA (heparin-binding domain, carbohydrate recognition domain, and the RGD triplet motif) were constructed. The three fusion proteins and Mal85 (MBP-FHA type I domain) were used to map the binding sites for scFvs of types 1, 5, and 7 by ELISA. The results showed that all three scFvs bound to the heparin-binding domain fusion protein but not the other fusion proteins. BALB/c mice who received recombinant phage-treated B. pertussis had reduced bacterial counts in the nasal cavity, trachea, and lungs compared to the control groups.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».