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Enregistrement W2166071762 · doi:10.1111/j.1758-2229.2012.00393.x

Temporal stability of the mouse gut microbiota in relation to innate and adaptive immunity

2012· article· en· W2166071762 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology Reports · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTula Foundation
Mots-clésBiologyImmune systemAcquired immune systemGut floraImmunityInnate immune systemMicrobiologyBacteriaPyrosequencingImmunologyZoologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gut microbial community properties of mammals are thought to be partly shaped by a combination of host immunity and environmental factors, but their relative importance is not firmly established. To address this gap, we first characterized the faecal bacteria of mice with a functioning immune system (wild-type, WT), mice with defective immune responses (CD45), mice lacking an adaptive immune system (RAG), and mice with both immune dysfunctions (45RAG). Using fingerprinting of 16S rRNA genes, we observed significant differences in gut microbiota composition across all mouse strains (P < 0.001) and identified several mouse strain-specific genera via pyrosequencing, including Turicibacter sp. (in WT mice) and Allobaculum sp. (in CD45-deficient animals). To define the role of the host immune system in constraining gut microbiota stability after perturbation, we cohoused CD45-deficient and WT mice and monitored gut bacterial community dynamics during 8 weeks. Cohousing caused the WT bacterial communities to become indistinguishable from those of CD45 mice (P > 0.05). Time-series analysis indicated that the communities of cohoused mice changed directionally as opposed to the relatively stable communities of non-cohoused controls. When we considered only taxonomic membership, it was the communities of CD45 non-cohoused mice that experienced the highest rate of change. Rather than be governed by fluctuations in the relative abundance of taxa, we suggest that CD45-regulated immune responses either are stimulated by the presence of bacteria per se or promote temporal stability by selecting for the occurrence of specific taxa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,177
Score d'incertitude au seuil0,486

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle