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Enregistrement W2166196825 · doi:10.1128/jcm.02262-14

Serogroup-Specific Bacterial Engineered Glycoproteins as Novel Antigenic Targets for Diagnosis of Shiga Toxin-Producing-Escherichia coli-Associated Hemolytic-Uremic Syndrome

2014· article· en· W2166196825 sur OpenAlexaff
Luciano J. Melli, Andrés E. Ciocchini, Ana J. Caillava, Nicolás Vozza, Isabel Chinen, Marta Rivas, Mario F. Feldman, Juan E. Ugalde, Diego J. Comerci

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerotypeMicrobiologyEscherichia coliAntigenSerologyShiga toxinBiologyVirologyAntibodyImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human infection with Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) is a major cause of postdiarrheal hemolytic-uremic syndrome (HUS), a life-threatening condition characterized by hemolytic anemia, thrombocytopenia, and acute renal failure. E. coli O157:H7 is the dominant STEC serotype associated with HUS worldwide, although non-O157 STEC serogroups can cause a similar disease. The detection of anti-O157 E. coli lipopolysaccharide (LPS) antibodies in combination with stool culture and detection of free fecal Shiga toxin considerably improves the diagnosis of STEC infections. In the present study, we exploited a bacterial glycoengineering technology to develop recombinant glycoproteins consisting of the O157, O145, or O121 polysaccharide attached to a carrier protein as serogroup-specific antigens for the serological diagnosis of STEC-associated HUS. Our results demonstrate that using these antigens in indirect ELISAs (glyco-iELISAs), it is possible to clearly discriminate between STEC O157-, O145-, and O121-infected patients and healthy children, as well as to confirm the diagnosis in HUS patients for whom the classical diagnostic procedures failed. Interestingly, a specific IgM response was detected in almost all the analyzed samples, indicating that it is possible to detect the infection in the early stages of the disease. Additionally, in all the culture-positive HUS patients, the serotype identified by glyco-iELISAs was in accordance with the serotype of the isolated strain, indicating that these antigens are valuable not only for diagnosing HUS caused by the O157, O145, and O121 serogroups but also for serotyping and guiding the subsequent steps to confirm diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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