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Enregistrement W2166219468 · doi:10.1074/jbc.m008444200

Granzyme B Induces BID-mediated Cytochrome c Release and Mitochondrial Permeability Transition

2001· article· en· W2166219468 sur OpenAlexaff
Judie B. Alimonti, Lianfa Shi, Priti K. Baijal, Arnold H. Greenberg

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial permeability transition poreCytochrome cChemistryCell biologyApoptosomeGranzyme BMitochondrial apoptosis-induced channelCytochromeMitochondrionApoptosisBiophysicsBiochemistryBiologyCaspaseProgrammed cell deathCytotoxicityIn vitroEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many cell death pathways converge at the mitochondria to induce release of apoptogenic proteins and permeability transition, resulting in the activation of effector caspases responsible for the biochemical and morphological alterations of apoptosis. The death receptor pathway has been described as a triphasic process initiated by the activation of apical caspases, a mitochondrial phase, and then the final phase of effector caspase activation. Granzyme B (GrB) activates apical and effector caspases as well as promotes cytochrome c (cyt c) release and loss of mitochondrial membrane potential. We investigated how GrB affects mitochondria utilizing an in vitro cell-free system and determined that cyt c release and permeability transition are initiated by distinct mechanisms. The cleavage of cytosolic BID by GrB results in truncated BID, initiating mitochondrial cyt c release. BID is the sole cytosolic protein responsible for this phenomenon in vitro, yet caspases were found to participate in cyt c release in some cells. On the other hand, GrB acts directly on mitochondria in the absence of cytosolic S100 proteins to open the permeability transition pore and to disrupt the proton electrochemical gradient. We suggest that GrB acts by two distinct mechanisms on mitochondria that ultimately lead to mitochondrial dysfunction and cellular demise.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations154
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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