Entry exclusion in F-like plasmids requires intact TraG in the donor that recognizes its cognate TraS in the recipient
Notice bibliographique
Résumé
The mating pair stabilization (Mps) protein of the F plasmid, TraG, is unique to F-like type IV secretion systems. TraG is a polytopic inner-membrane protein with a large C-terminal periplasmic domain that is required for piliation and Mps, whereas the N-terminal region is sufficient for pilus synthesis. The C-terminal region of TraG is thought to be cleaved by the host signal peptidase I to give a fragment called TraG* that is responsible for Mps. Using mutational analysis and cell localization studies, it was shown that TraG* is most probably an artifact caused by non-specific degradation. TraS (173 aa in F), which is involved in entry exclusion (Eex), blocks redundant conjugative DNA synthesis and transport between donor cells, suggesting that it interferes with a signalling pathway required to trigger DNA transfer. Using the F and R100 plasmids, TraG in the donor cell was found to recognize TraS in the recipient cell inner membrane, in a plasmid-specific manner. This activity mapped to aa 610-673 in F TraG, the only region that differs significantly from R100 TraG. Expression of traG or traG* in a recipient cell did not affect mating ability or Eex. These results suggest that TraG may be translocated to the recipient cell, where it contacts the inner membrane, initiating transfer, a process that is blocked by TraS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».