Serum metabolomic profile as a means to distinguish stage of colorectal cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Presently, colorectal cancer (CRC) is staged preoperatively by radiographic tests, and postoperatively by pathological evaluation of available surgical specimens. However, present staging methods do not accurately identify occult metastases. This has a direct effect on clinical management. Early identification of metastases isolated to the liver may enable surgical resection, whereas more disseminated disease may be best treated with palliative chemotherapy. METHODS: Sera from 103 patients with colorectal adenocarcinoma treated at the same tertiary cancer center were analyzed by proton nuclear magnetic resonance (1H NMR) spectroscopy and gas chromatography-mass spectroscopy (GC-MS). Metabolic profiling was done using both supervised pattern recognition and orthogonal partial least squares-discriminant analysis (O-PLS-DA) of the most significant metabolites, which enables comparison of the whole sample spectrum between groups. The metabolomic profiles generated from each platform were compared between the following groups: locoregional CRC (N = 42); liver-only metastases (N = 45); and extrahepatic metastases (N = 25). RESULTS: The serum metabolomic profile associated with locoregional CRC was distinct from that associated with liver-only metastases, based on 1H NMR spectroscopy (P = 5.10 × 10-7) and GC-MS (P = 1.79 × 10-7). Similarly, the serum metabolomic profile differed significantly between patients with liver-only metastases and with extrahepatic metastases. The change in metabolomic profile was most markedly demonstrated on GC-MS (P = 4.75 × 10-5). CONCLUSIONS: In CRC, the serum metabolomic profile changes markedly with metastasis, and site of disease also appears to affect the pattern of circulating metabolites. This novel observation may have clinical utility in enhancing staging accuracy and selecting patients for surgical or medical management. Additional studies are required to determine the sensitivity of this approach to detect subtle or occult metastatic disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».