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Enregistrement W2166496008 · doi:10.1093/hmg/ddu002

Loss-of-function HDAC8 mutations cause a phenotypic spectrum of Cornelia de Lange syndrome-like features, ocular hypertelorism, large fontanelle and X-linked inheritance

2014· article· en· W2166496008 sur OpenAlex
Frank J. Kaiser, Morad Ansari, Diana Braunholz, María Concepción Gil‐Rodríguez, Christophe Decroos, Jonathan J. Wilde, Christopher T. Fincher, Maninder Kaur, Masashige Bando, David J. Amor, Paldeep S. Atwal, Melanie Bahlo, Christine M. Bowman, Jacquelyn J. Bradley, Han G. Brunner, Dinah Clark, Miguel Del Campo, Nataliya Di Donato, Peter Diakumis, Holly Dubbs, David A. Dyment, Juliane Eckhold, Sarah Ernst, José Carlos Ferreira, Lauren J. Francey, Ulrike Gehlken, Encarna Guillén‐Navarro, Yolanda Gyftodimou, Bryan D. Hall, Raoul C. M. Hennekam, Louanne Hudgins, Melanie Hullings, Jennifer M. Hunter, Helger G. Yntema, A. Micheil Innes, Antonie D. Kline, Zita Krūmiņa, Hane Lee, Kathleen A. Leppig, Sally Ann Lynch, Mark Mallozzi, Linda Mannini, Shane McKee, Sarju Mehta, Ieva Mičule, Shehla Mohammed, Ellen Moran, Geert Mortier, J. Moser, Sarah E. Noon, Naohito Nozaki, Luís Nunes, John Pappas, Lynette S. Penney, Antonio Pérez Aytés, Michael B. Petersen, Beatriz Puisac, Nicole Revençu, Elizabeth Roeder, Sulagna C. Saitta, Angela E. Scheuerle, Karen L. Schindeler, Victoria Mok Siu, Zornitza Stark, Samuel P. Strom, Heidi Thiese, Inga Vater, Patrick J. Willems, Kathleen A. Williamson, Louise C. Wilson, Håkon Håkonarson, Fabiola Quintero‐Rivera, Jolanta Wierzba, Antonio Musio, Gabriele Gillessen‐Kaesbach, Feliciano J. Ramos, Laird G. Jackson, Katsuhiko Shirahige, Juan Pié, David W. Christianson, Ian D. Krantz, David Fitzpatrick, Matthew A. Deardorff

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie UniversityWestern UniversityAlberta Children's HospitalChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Human Genome Research InstituteUniversity of California, Los Angeles
Mots-clésBiologyGeneticsHypertelorismPhenotypeAnterior fontanelleX-linked recessive inheritanceMutationCraniosynostosisInheritance (genetic algorithm)Non-Mendelian inheritanceLoss functionX chromosomeGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cornelia de Lange syndrome (CdLS) is a multisystem genetic disorder with distinct facies, growth failure, intellectual disability, distal limb anomalies, gastrointestinal and neurological disease. Mutations in NIPBL, encoding a cohesin regulatory protein, account for >80% of cases with typical facies. Mutations in the core cohesin complex proteins, encoded by the SMC1A, SMC3 and RAD21 genes, together account for ∼5% of subjects, often with atypical CdLS features. Recently, we identified mutations in the X-linked gene HDAC8 as the cause of a small number of CdLS cases. Here, we report a cohort of 38 individuals with an emerging spectrum of features caused by HDAC8 mutations. For several individuals, the diagnosis of CdLS was not considered prior to genomic testing. Most mutations identified are missense and de novo. Many cases are heterozygous females, each with marked skewing of X-inactivation in peripheral blood DNA. We also identified eight hemizygous males who are more severely affected. The craniofacial appearance caused by HDAC8 mutations overlaps that of typical CdLS but often displays delayed anterior fontanelle closure, ocular hypertelorism, hooding of the eyelids, a broader nose and dental anomalies, which may be useful discriminating features. HDAC8 encodes the lysine deacetylase for the cohesin subunit SMC3 and analysis of the functional consequences of the missense mutations indicates that all cause a loss of enzymatic function. These data demonstrate that loss-of-function mutations in HDAC8 cause a range of overlapping human developmental phenotypes, including a phenotypically distinct subgroup of CdLS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,574
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle