GENETIC POPULATION STRUCTURE OF <i>PSEUDO‐NITZSCHIA PUNGENS</i> (BACILLARIOPHYCEAE) FROM THE PACIFIC NORTHWEST AND THE NORTH SEA<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
Several species of the diatom Pseudo-nitzschia produce the neurotoxin domoic acid (DA). Consumption of fish and shellfish that have accumulated this potent excitotoxin has resulted in severe illness and even death in humans, marine mammals, and seabirds. Pseudo-nitzschia pungens (Grunow ex Cleve) Hasle is a cosmopolitan diatom commonly occurring in the waters of the Pacific Northwest (PNW) and the eastern North Atlantic, including the North Sea. However, genetic and physiological relationships among populations throughout this large geographic distribution have not been assessed. Population genetic parameters (e.g., Hardy-Weinberg equilibrium, linkage equilibrium, FST ) calculated for P. pungens collected from the Juan de Fuca eddy region in the PNW indicated the presence of two distinct groups that were more divergent from each other than either was from a P. pungens sample from the North Sea. Geographic heterogeneity was also detected within each of the two PNW groups. These results suggested that the populations of P. pungens recently mixed in the Juan de Fuca eddy region (a seasonally retentive feature off the coasts of Washington State, USA, and Vancouver Island, Canada) but did not exchange genetic material by sexual reproduction. Alternatively, these two groups may be cryptic (morphologically identical, but reproductively isolated) species. Identifying cryptic diversity in Pseudo-nitzschia is important for bloom prediction and aiding the identification of molecular markers that can be used for rapid detection assay development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».