Identification of resistance genes to barley covered smut and mapping of the<i>Ruh1</i>gene using<i>Ustilago hordei</i>strains with defined avirulence genes
Notice bibliographique
Résumé
Covered smut of barley (Hordeum vulgare), caused by Ustilago hordei, is a seed-borne disease. To identify and map disease resistance genes, current Canadian barley cultivars, parents of six barley mapping populations, and four differentials namely ‘Hannchen’ (Ruh1), ‘Excelsior’ (Ruh2), ‘Plush’ (Ruh6), and ‘Odessa’ (universal susceptible), were evaluated. Six mated combinations of U. hordei sporidial lines harbouring known alleles of virulence (avr) and avirulence (Avr) genes were used in the evaluation. Most of the barley cultivars carried the Ruhl resistance gene, but some also had Ruh2 or Ruh6. Many cultivars showed resistance to a U. hordei sporidial mating of genotype (avr1/avr1 avr2/avr2 avr6/avr6), virulent on ‘Hannchen’, ‘Excelsior’, and ‘Plush’. The resistance indicated the presence of novel avirulence gene(s) corresponding to a postulated resistance gene(s) in these cultivars. Fifty-six doubled-haploid lines from the mapping population ‘Harrington’/TR306 were inoculated with a sporidial mating of genotype SMI (Avr1/Avr1 avr2/avr2 avr6/avr6), avirulent on ‘Hannchen’ (Ruhl) but virulent on ‘Excelsior’ (Ruh2) and ‘Plush’ (Ruh6). ‘Harrington’ (ruh1) was susceptible to this fungal genotype possessing Avrl and TR306 (Ruhl) was resistant. Based on field and greenhouse tests, barley lines segregated 27 resistant to 29 susceptible, which was not significantly different from a I: I ratio (X 2 = 0.07, P = 0.79); this indicated the presence of the single major resistance gene Ruhl in TR306. Ruhl mapped to the short arm of chromosome I (7H) between markers iPgd1A and BCD 129 on the ‘Harrington’/TR306 map.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».