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Enregistrement W2166767145 · doi:10.1152/physiolgenomics.00003.2011

Systems genetics of susceptibility to obesity-induced diabetes in mice

2011· article· en· W2166767145 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMerckNational Institutes of HealthAmerican Diabetes Association
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyExpression quantitative trait lociLeptin receptorDiabetes mellitusOffspringLeptinGeneticsObesityCandidate geneGeneLocus (genetics)Inbred strainEndocrinologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inbred strains of mice are strikingly different in susceptibility to obesity-driven diabetes. For instance, deficiency in leptin receptor (db/db) leads to hyperphagia and obesity in both C57BL/6 and DBA/2 mice, but only on the DBA/2 background do the mice develop beta-cell loss leading to severe diabetes, while C57BL/6 mice are relatively resistant. To further investigate the genetic factors predisposing to diabetes, we have studied leptin receptor-deficient offspring of an F2 cross between C57BL/6J (db/+) males and DBA/2J females. The results show that the genetics of diabetes susceptibility are enormously complex and a number of quantitative trait loci (QTL) contributing to diabetes-related traits were identified, notably on chromosomes 4, 6, 7, 9, 10, 11, 12, and 19. The Chr. 4 locus is likely due to a disruption of the Zfp69 gene in C57BL/6J mice. To identify candidate genes and to model coexpression networks, we performed global expression array analysis in livers of the F2 mice. Expression QTL (eQTL) were identified and used to prioritize candidate genes at clinical trait QTL. In several cases, clusters of eQTLs colocalized with clinical trait QTLs, suggesting a common genetic basis. We constructed coexpression networks for both 5 and 12 wk old mice and identified several modules significantly associated with clinical traits. One module in 12 wk old mice was associated with several measures of hepatic fat content as well as with other lipid- and diabetes-related traits. These results add to the understanding of the complex genetic interactions contributing to obesity-induced diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,463
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle