Karyopherins in nuclear pore biogenesis
Notice bibliographique
Résumé
The mechanisms that govern the assembly of nuclear pore complexes (NPCs) remain largely unknown. Here, we have established a role for karyopherins in this process. We show that the yeast karyopherin Kap121p functions in the targeting and assembly of the nucleoporin Nup53p into NPCs by recognizing a nuclear localization signal (NLS) in Nup53p. This karyopherin-mediated function can also be performed by the Kap95p-Kap60p complex if the Kap121p-binding domain of Nup53p is replaced by a classical NLS, suggesting a more general role for karyopherins in NPC assembly. At the NPC, neighboring nucleoporins bind to two regions in Nup53p. One nucleoporin, Nup170p, associates with a region of Nup53p that overlaps with the Kap121p binding site and we show that they compete for binding to Nup53p. We propose that once targeted to the NPC, dissociation of the Kap121p-Nup53p complex is driven by the interaction of Nup53p with Nup170p. At the NPC, Nup53p exists in two separate complexes, one of which is capable of interacting with Kap121p and another that is bound to Nup170p. We propose that fluctuations between these two states drive the binding and release of Kap121p from Nup53p, thus facilitating Kap121p's movement through the NPC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».