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Enregistrement W2166779318 · doi:10.1074/jbc.m109261200

Crystal Structures of Active and Inactive Conformations of a Caliciviral RNA-dependent RNA Polymerase

2002· article· en· W2166779318 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Research Resources
Mots-clésPolymeraseRNA polymeraseRNAVirusHepatitis C virusRNA-dependent RNA polymeraseEnzymeStereochemistryChemistryActive siteVirologyBiologyCrystallographyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The structure of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) from the rabbit hemorrhagic disease virus has been determined by x-ray crystallography to a 2.5-A resolution. The overall structure resembles a "right hand," as seen before in other polymerases, including the RdRPs of polio virus and hepatitis C virus. Two copies of the polymerase are present in the asymmetric unit of the crystal, revealing active and inactive conformations within the same crystal form. The fingers and palm domains form a relatively rigid unit, but the thumb domain can adopt either "closed" or "open" conformations differing by a rigid body rotation of approximately 8 degrees. Metal ions bind at different positions in the two conformations and suggest how structural changes may be important to enzymatic function in RdRPs. Comparisons between the structures of the alternate conformational states of rabbit hemorrhagic disease virus RdRP and the structures of RdRPs from hepatitis C virus and polio virus suggest novel structure-function relationships in this medically important class of enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,660

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle