Detection of border disease virus (BDV) in goat herds suffering diarrhea in eastern China
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Border disease virus (BDV) is an important pathogen in sheep and goat production. Neither epidemiological investigation nor any reports of BDV infection was available in China. During Jan to Apr, 2012, several herd goats in Anhui and Jiangsu provinces in eastern China suffered unremitting diarrhea, with morbidity and mortality of about 28-37% and 10-15%, respectively. In the present study, sera and tissue samples from diseased goats of four farms were taken for BDV detection, isolation and identification. RESULTS: Panpesti generic primers and border disease virus (BDV)-specific primers targeting the 5'-UTR region produced RT-PCR positive bands for sera (24/28) and tissue samples (7/30). Twenty positive sera and tissue samples were inoculated onto Madin-Darby bovine kidney (MDBK) cells for virus isolation. Finally, three different strains of BDV, named AH12-01, AH12-02 and JS12/04, were successfully isolated as identified by RT-PCR using 5'-UTR and N(pro) gene primers, sequencing and electron microscopy. Sequences of 5'-UTR and N(pro) genes of them were used for phylogenetic analysis and comparison to other reference sequences available in GenBank. The results indicated AH12-01, AH12-02 and JS12/04 possess high relationship with the BDV 3 group viruses and differed with each other. CONCLUSION: This is the first detection of BDV from goats with diarrhea and confirmation of BDV infection in China.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».