Characterization of the Novel Factor Paa Involved in the Early Steps of the Adhesion Mechanism of Attaching and Effacing <i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
Nonenterotoxigenic porcine Escherichia coli strains belonging to the serogroup O45 have been associated with postweaning diarrhea in swine and adhere to intestinal epithelial cells in a characteristic attaching and effacing (A/E) pattern. O45 porcine enteropathogenic E. coli (PEPEC) strain 86-1390 induces typical A/E lesions in a pig ileal explant model. Using TnphoA transposon insertion mutagenesis on strain 86-1390, we found a mutant that did not induce A/E lesions. The insertion was identified in a gene designated paa (porcine A/E-associated gene). Sequence analysis of paa revealed an open reading frame of 753 bp encoding a 27.6-kDa protein which displayed 100, 51.8, and 49% homology with Paa of enterohemorrhagic E. coli O157:H7 strains (EDL933 and Sakai), PEB3 of Campylobacter jejuni, and AcfC of Vibrio cholerae, respectively. Chromosomal localization studies indicated that the region containing paa was inserted between the yciD and yciE genes at about 28.3 min of the E. coli K-12 chromosome. The presence of paa and eae sequences in the porcine O45 strains is highly correlated with the A/E phenotype. However, the observation that three eae-positive but paa-negative PEPEC O45 strains were A/E negative provides further evidence for the importance of the paa gene in the A/E activity of O45 strains. As well, the complementation of the paa mutant restored the A/E activity of the 86-1390 strain, showing the involvement of Paa in PEPEC pathogenicity. These observations suggest that Paa contributes to the early stages of A/E E. coli virulence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».