Nodular symbionts of<i>Shepherdia</i>,<i>Alnus</i>, and<i>Myrica</i>from a sand dune ecosystem: trends in occurrence of soilborne<i>Frankia</i>genotypes
Notice bibliographique
Résumé
A successional sand dune system along the Lake Michigan shoreline was chosen to study the impact of edaphic factors, vegetation cover, and topographic position on Frankia strain distribution and infectivity. On this site, three actinorhizal species, Myrica gale L., Alnus incana (L.) Moench subsp. rugosa (Du Roi) Clausen, and Shepherdia canadensis (L.) Nutt., grew in different communities. Soil samples were collected on plots devoid of actinorhizal plants and serially diluted to inoculate the three native host plants in a greenhouse study. Strains present in the nodules formed were then genetically characterized using PCR-RFLP of the 16S23S intergenic spacer (IGS). An additional study site was included to estimate the impact of the sympatric presence of the three host species on soil infectivity and strain diversity. On this second site, soils used as inocula were collected in the rhizosphere of M. gale and S. canadensis. The M. gale and A. incana nodular strains belonged to an homogeneous cluster, whereas the S. cana densis nodular strains were separated into two distinct genetic clusters, irrespective of edaphic conditions and proximity to the host's root systems. A χ2analysis conducted on Shepherdia-infective strains showed the dominance of two distinct genotypes, with one of them being specific to newly formed dunes lacking plant cover and the other specific to older, stable dunes with dense vegetative cover.Key words: Frankia, Myrica, Shepherdia, Alnus, IGS 16S23S, sand dunes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».