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Enregistrement W2166947688 · doi:10.1164/rccm.200503-425oc

Imbalance between Cysteine Proteases and Inhibitors in a Baboon Model of Bronchopulmonary Dysplasia

2005· article· en· W2166947688 sur OpenAlexaff
Ozden Altiok, Ryuji Yasumatsu, Gulbin Bingol-Karakoc, Richard J. Riese, Mildred T. Stahlman, William Dwyer, Richard A. Pierce, Dieter Brömme, Ekkehard Weber, Sule Çataltepe

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésProteasesCystatinCathepsin BCathepsinCathepsin SCathepsin HMolecular biologyCathepsin CCathepsin LCystatin CCysteine proteaseBiologyPathologyMedicineBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: Bronchopulmonary dysplasia (BPD) continues to be a major morbidity in preterm infants. The lung pathology in BPD is characterized by impaired alveolar and capillary development. An imbalance between proteases and protease inhibitors in association with changes in lung elastic fibers has been implicated in the pathogenesis of BPD. OBJECTIVE: To investigate the expression and activity levels of papain-like lysosomal cysteine proteases, cathepsins B, H, K, L, S, and their inhibitors, cystatins B and C, in a baboon model of BPD. METHODS: Real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction, immunohistochemistry, immunoblotting, active site labeling of cysteine proteases, and in situ hybridization were performed. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: The steady-state mRNA and protein levels of all cathepsins were significantly increased in the lung tissue of baboons with BPD. In contrast, the steady-state mRNA and protein levels of two major cysteine protease inhibitors, cystatin B and C, were unchanged. Correlating with these alterations, the activity of cysteine proteases in lung tissue homogenates and bronchoalveolar lavage fluid was significantly higher in the BPD group. The levels of cathepsin B, H, and S increased and cathepsin K decreased with advancing gestation. All cathepsins, except for cat K, were immunolocalized to macrophages in BPD. In addition, cathepsin H and cystatin B were colocalized in type 2 alveolar epithelial cells. Cathepsin L was detected in some bronchial epithelial, endothelial, and interstitial cells. Cathepsin K was localized to some perivascular cells by in situ hybridization. CONCLUSIONS: Cumulatively, these findings demonstrate an imbalance between cysteine proteases and their inhibitors in BPD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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