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Enregistrement W2166972123 · doi:10.1093/jxb/ers135

A MYB transcription factor from the grey mangrove is induced by stress andconfers NaCl tolerance in tobacco

2012· article· en· W2166972123 sur OpenAlexaff
H. M. Sankararamasubramanian, G. Ashwin, Ajay Parida

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCouncil of Scientific and Industrial Research, India
Mots-clésMYBTranscription factorMangroveBiologyBotanyGeneticsGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MYB transcription factor genes play important roles in developmental and various other processes in plants. In this study, functional characterization of AmMYB1, a single-repeat MYB transcription factor isolated from the salt-tolerant mangrove tree Avicennia marina is reported. AmMYB1 cDNA was 1046 bp in length with an open reading frame of 783 bp, encoding 260 amino acids. The corresponding gene had two introns and three exons and was present as a single copy in A. marina. The deduced amino acid sequence showed similarities to MYB proteins reported in other plants, including the conserved MYB binding domain. RNA gel blot analysis showed that the AmMYB1 transcript expression was more pronounced in green photosynthetic tissue and was strongly induced by stresses such as salt (500 mM), light (500 µE m(-2) s(-1)), and the exogenous application of ABA (100 µM). An analysis of the upstream sequence of AmMYB1 gene revealed the presence of regulatory elements identical to those present in the promoters of stress inducible genes. The promoter was responsive to NaCl and could enhance reporter gene expression in planta. An in vitro DNA binding assay using the promoter region (TGGTTAG) of the AtRD22 gene and a transactivation assay in yeast cells suggest the possibility of AmMYB1 protein regulating the expression of other genes during salt stress. Transgenic tobacco plants constitutively expressing the AmMYB1 transcription factor showed better tolerance to NaCl stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,395
Score d'incertitude au seuil0,551

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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