Novel exon 1 mutations in <i>MECP2</i> implicate isoform MeCP2_e1 in classical Rett syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Rett syndrome (RTT) is a neurodevelopmental disorder caused by mutations in the X-linked MECP2 gene. Recently, a new MeCP2 isoform was described, MeCP2_e1, which skips exon 2 and has an alternative N-terminus, translated from exon 1, whereas MeCP2_e2 is translated from a start codon in exon 2. Since the incorporation of exon 1 into standard sequencing protocols for RTT, few exon 1 mutations have been described and are thus assumed to be only rare causes of RTT. Also, studies have suggested that the frameshift mutations identified in exon 1 affect both isoforms. Our aim in this study was to assess the frequency of mutations in exon 1, their relationship to phenotype, and the implications on the etiological role for the isoform MeCP2_e1 in RTT, versus the previously described isoform, MeCP2_e2. We sequenced MECP2 in 51 females with various clinical presentations, including developmental delay, autism, atypical and classical RTT, referred to our laboratories for testing. In patients with identified mutations, X-chromosome inactivation was analyzed. We identified four patients with exon 1 mutations; three were novel (c.1A > T; c.1A > G; c.5C > T), two of which affected the start codon, one a missense change, and one patient had a previously reported splice site mutation, c.62 + 1delGT. The four patients fit criteria for classical RTT, and thus these findings add support to previous reports that exon 1 mutations may be associated with a severe phenotype. Also, these findings add significant weight to the mounting evidence suggesting that the MeCP2_e1 isoform is the etiologically relevant form of the protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».