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Enregistrement W2167014093 · doi:10.1128/aem.01289-09

Effect of Environmental Factors and Influence of Rumen and Hindgut Biogeography on Bacterial Communities in Steers

2010· article· en· W2167014093 sur OpenAlexafffund
Gustavo A. Romero‐Pérez, Kim Ominski, Tim A. McAllister, Denis O. Krause

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesUniversity of Manitoba
Mots-clésRumenBiologyFirmicutesHindgutSilageAnimal scienceFecesPopulationVerrucomicrobiaFermentationFodderBacteroidetesFood scienceAgronomyBotanyBacteriaEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Feces from cattle production are considered important sources of bacterial contamination of food and the environment. Little is known about the combined effects of arctic temperatures and fodder tannins on rumen and hindgut bacterial populations. Individual rumen liquor and rectal fecal samples from donor steers fed either alfalfa silage or sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) silage and water ad libitum were collected weekly on the first three sampling days and fortnightly afterwards. The daily ambient temperatures were registered and averaged to weekly mean temperatures. Steers fed sainfoin silage had lower (P < 0.05) concentrations of branched-chain volatile fatty acids (VFA) than those fed alfalfa silage. All VFA concentrations were higher (P < 0.001) in rumen liquor samples than in fecal samples. The interaction of sample type and diet showed a significant effect (P < 0.05) on the proportions of the bacterial community that were from the phyla Proteobacteria and Verrucomicrobia. Ambient temperature had an indirect effect (P < 0.05) on the phylum Firmicutes, as it affected its proportional balance. The bacterial population diversity in samples appeared to decrease concurrently with the ambient temperature. The phylum Firmicutes explained the first principal component at 64.83 and 42.58% of the total variance in rumen liquor and fecal samples, respectively. The sample type had a larger effect on bacterial communities than diet and temperature. Certain bacterial populations seemed to be better adapted than others to environmentally adverse conditions, such as less access time to nutrients due to higher motility and rate of passage of digesta caused by extreme temperatures, or antimicrobials such as tannins, possibly due to an influence of their biogeographical location within the gut.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,573
Score d'incertitude au seuil0,358

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,162
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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