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Enregistrement W2167149280 · doi:10.1093/toxsci/kfn169

Retinoic Acid Receptor Gamma-Induced Misregulation of Chondrogenesis in the Murine Limb Bud In Vitro

2008· article· en· W2167149280 sur OpenAlexaff
Eugene Galdones, Barbara F. Hales

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLimb budChondrogenesisIn vitroRetinoic acidCell biologyChemistryLimb developmentReceptorBiologyBiochemistryEmbryoGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vitamin A derivatives modulate gene expression through retinoic acid and rexinoid receptor (RAR/RXR) heterodimers and are indispensable for limb development. Of particular interest, RARgamma is highly expressed in cartilage, a target affected following retinoid-induced limb insult. The goal of this study was to examine how selective activation of RARgamma affects limb development. Forelimbs from E12.5 CD-1 mice were cultured for 6 days in the presence of all-trans RA (pan-RAR agonist; 0.1 or 1.0 microM) or BMS-189961 (BMS961, RARgamma-selective agonist; 0.01 or 0.1 microM) and limb morphology assessed. Untreated limbs developed normal cartilage elements whereas pan-RAR or RARgamma agonist-treated limbs exhibited reductive effects on chondrogenesis. Retinoid activity was assessed using RAREbeta2 (retinoic acid response element beta2)-lacZ reporter limbs; after 3 h of treatment, both drugs increased retinoid activity proximally. To elucidate the expression profiles of a subset of genes important for development, limbs were cultured for 3 h and cRNA hybridized to osteogenesis-focused microarrays. Two genes, matrix GLA protein (Mgp; chondrogenesis inhibitor) and growth differentiation factor-10 (Gdf10/Bmp3b) were induced by RA and BMS-189961. Real-time PCR was done to validate our results and whole mount in situ hybridizations against Mgp and Gdf10 localized their upregulation to areas of cartilage and programmed cell death, respectively. Thus, our results illustrate the importance of RARgamma in mediating the retinoid-induced upregulation of Mgp and Gdf10; determining their roles in chondrogenesis and cell death will help further unravel mechanisms underlying retinoid teratogenicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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