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Enregistrement W2167219284 · doi:10.1186/s12881-014-0120-7

A study of genes encoding cytokines (IL6, IL10, TNF), cytokine receptors (IL6R, IL6ST), and glucocorticoid receptor (NR3C1) and susceptibility to bronchopulmonary dysplasia

2014· article· en· W2167219284 sur OpenAlex
Johanna M. Huusko, Minna K. Karjalainen, Mari Mahlman, Ritva Haataja, M. Anneli Kari, Sture Andersson, Gergely Toldi, Outi Tammela, Mika Rämet, Pascal M. Lavoie, Mikko Hallman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensChild and Family Research Institute
Organismes subventionnairesTaysOulun YliopistoEmil Aaltosen SäätiöAcademy of FinlandHelsingin YliopistoKuopion Yliopistollinen SairaalaHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriMichael Smith Health Research BCUniversity of OttawaBritish Columbia Lung AssociationTurun Yliopistollinen KeskussairaalaStiftelsen Alma och K. A. Snellman Säätiö
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismBiologyImmunologyGlucocorticoid receptorBronchopulmonary dysplasiaInternal medicineGlucocorticoidGeneticsMedicineGenotypeGenePregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Bronchopulmonary dysplasia (BPD) is a common chronic lung disease associated with very preterm birth. The major risk factors include lung inflammation and lung immaturity. In addition, genetic factors play an important role in susceptibility to moderate-to-severe BPD. In this study, the aim was to investigate whether common polymorphisms of specific genes that are involved in inflammation or differentiation of the lung have influence on BPD susceptibility. METHODS: Genes encoding interleukin-6 (IL6) and its receptors (IL6R and IL6ST), IL-10 (IL10), tumor necrosis factor (TNF), and glucocorticoid receptor (NR3C1) were assessed for associations with moderate-to-severe BPD susceptibility. Five IL6, nine IL6R, four IL6ST, one IL10, two TNF, and 23 NR3C1 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were analyzed in very preterm infants born in northern Finland (56 cases and 197 controls) and Canada (58 cases and 68 controls). IL-6, TNF and gp130 contents in umbilical cord blood, collected from very preterm infants, were studied for associations with the polymorphisms. Epistasis (i.e., interactions between SNPs in BPD susceptibility) was also examined. SNPs showing suggestive associations were analyzed in additional replication populations from Finland (39 cases and 188 controls) and Hungary (29 cases and 40 controls). RESULTS: None of the studied SNPs were associated with BPD nor were the IL6, TNF or IL6ST SNPs associated with cord blood IL-6, TNF and gp130, respectively. However, epistasis analysis suggested that SNPs in IL6ST and IL10 were associated interactively with risk of BPD in the northern Finnish population; however, this finding did not remain significant after correction for multiple testing and the finding was not replicated in the other populations. CONCLUSIONS: We conclude that the analyzed SNPs within IL6, IL6R, IL6ST, IL10, TNF, and NR3C1 were not associated with BPD. Furthermore, there was no evidence that the studied SNPs directly contribute to the cord blood protein contents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,262
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle