MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2167245757 · doi:10.1111/tpj.12670

Arabidopsis <scp>RAV</scp>1 transcription factor, phosphorylated by <scp>S</scp>n<scp>RK</scp>2 kinases, regulates the expression of <i><scp>ABI</scp>3</i>,<i><scp>ABI</scp>4</i>, and <i><scp>ABI</scp>5</i> during seed germination and early seedling development

2014· article· en· W2167245757 sur OpenAlexfundno aff
Cuizhu Feng, Yun Chen, Cun Wang, You‐Han Kong, Weihua Wu, Yifang Chen

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of ChinaInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesChina Agricultural UniversityNational Science Foundation
Mots-clésAbscisic acidArabidopsisTranscription factorKinasePhosphorylationPhenotypeBiologyCell biologyChemistryMutantMolecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phytohormone abscisic acid (ABA) modulates a number of processes during plant growth and development. In this study, the molecular mechanism of Arabidopsis RAV (Related to ABI3/VP1) transcription factor RAV1 involving ABA signaling was investigated. RAV1-underexpressing lines were more sensitive to ABA than wild-type plants during seed germination and early seedling development, whereas RAV1-overexpressing lines showed strong ABA-insensitive phenotypes. Overexpression of RAV1 repressed ABI3, ABI4, and ABI5 expression, and RAV1 bound to the ABI3, ABI4, and ABI5 promoters in vitro and in vivo, indicating that RAV1 directly down-regulates the expression of ABI3, ABI4, and ABI5. The interruption of ABI5 function in RAV1-U abi5 plants abolished the ABA-hypersensitive phenotype of RAV1-U plants, demonstrating that ABI5 is epistatic to RAV1. RAV1 interacted with SNF1-RELATED PROTEIN KINASE SnRK2.2, SnRK2.3 and SnRK2.6 in the nucleus. In vitro kinase assays showed that SnRK2.2, SnRK2.3 and SnRK2.6 phosphorylated RAV1. Transient expression assays revealed that SnRK2.2, SnRK2.3 and SnRK2.6 reduced the RAV1-dependent repression of ABI5, and the ABA-insensitive phenotype of the RAV1-overexpressing line was impaired by overexpression of SnRK2.3 in the RAV1 OE3 plants. Together, these results demonstrated that the Arabidopsis RAV1 transcription factor plays an important role in ABA signaling by modulating the expression of ABI3, ABI4, and ABI5, and that its activity is negatively affected by SnRK2s.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations298
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Plant JournalMême sujetPlant Stress Responses and ToleranceTravaux en français237 207