A Common<i>CD4</i>Gene Variant Is Associated with an Increased Risk of HIV‐1 Infection in Kenyan Female Commercial Sex Workers
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: It has been predicted that CD4 C868T, a novel CD4 single-nucleotide polymorphism (SNP) that has been found to be highly prevalent among Africans, changes the tertiary structure of CD4, which may alter susceptibility to human immunodeficiency virus (HIV) infection. METHODS: Participants were from a Kenyan cohort and included 87 uninfected and 277 HIV-1-infected individuals. DNA sequencing was used to determine CD4 genotype. A2.01 cells expressing similar levels of either wild-type CD4 or CD4-Trp240 as well as peripheral blood mononuclear cells from uninfected donors were infected with HIV-1(IIIB) or a Kenyan primary HIV-1 isolate. HIV-1 p24 enzyme-linked immunosorbent assay was used to determine the outcome of infection. RESULTS: CD4 C868T was found to be significantly more prevalent among HIV-1-infected participants than among HIV-1-uninfected participants (P = .002), and C868T was associated with an increased incidence of HIV-1 infection as well (P = .005, log-rank test; P = .009, Wilcoxon test), with an odds ratio of 2.49 (P = .009). Both in vitro and ex vivo models demonstrated a significant association between CD4 C868T and susceptibility to HIV-1 infection (P < .001 and P = .003, respectively). CONCLUSION: Overall, the present study found a strong correlation between CD4 C868T and increased susceptibility to HIV-1 infection. Given the high prevalence of both HIV infection and CD4 C868T in African populations, the effect of this SNP on the epidemic in Africa could be dramatic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».