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Enregistrement W2167471278 · doi:10.1139/w11-070

False-positive identification of<i>Escherichia coli</i>in treated municipal wastewater and wastewater-irrigated soils

2011· article· en· W2167471278 sur OpenAlexvenueno aff
Jean E. McLain, Channah Rock, Kathleen A. Lohse, James L. Walworth

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFecal contamination and water quality
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWastewaterChromogenicEscherichia coliSewageSoil waterEnvironmental scienceWater qualityAgarGroundwaterIrrigationSewage treatmentEffluentEnvironmental chemistryBiologyEnvironmental engineeringBacteriaChemistryChromatographyEcologySoil science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The increasing use of treated wastewater for irrigation heightens the importance of accurate monitoring of water quality. Chromogenic media, because they are easy to use and provide rapid results, are often used for detection of Escherichia coli in environmental samples, but unique levels of organic and inorganic compounds alter the chemistry of treated wastewater, potentially hindering the accurate performance of chromogenic media. We used MI agar and molecular confirmatory methods to assess false-positive identification of E. coli in treated wastewater samples collected from municipal utilities, an irrigation holding pond, irrigated soils, and in samples collected from storm flows destined for groundwater recharge. False-positive rates in storm flows (4.0%) agreed closely with USEPA technical literature but were higher in samples from the pond, soils, and treatment facilities (33.3%, 38.0%, and 48.8%, respectively). Sequencing of false-positive isolates confirmed that most were, like E. coli, of the family Enterobacteriaceae, and many of the false-positive isolates were reported to produce the β-D-glucuronidase enzyme targeted by MI agar. False-positive identification rates were inversely related to air temperature, suggesting that seasonal variations in water quality influence E. coli identification. Knowledge of factors contributing to failure of chromogenic media will lead to manufacturer enhancements in media quality and performance and will ultimately increase the accuracy of future water quality monitoring programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,092

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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