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Enregistrement W2167512650 · doi:10.1139/g01-073

Construction of a reference linkage map for melon

2001· article· en· W2167512650 sur OpenAlexvenueno aff
Marc Oliver, Jordi García-Más, M Cardús, Neus Pueyo, Anabel López-Sesé, M. Arroyo, H. Gómez-Paniagua, Pere Arús, Miguel Vicente

Notice bibliographique

RevueGenome · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvances in Cucurbitaceae Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConsejo Superior de Investigaciones Científicas
Mots-clésCucumisBiologyMelonGeneticsRestriction fragment length polymorphismGene mappingQuantitative trait locusGenetic linkageGenetic markerMolecular markerGeneBotanyHorticultureGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A map of melon (Cucumis melo L.) with 411 markers (234 RFLPs, 94 AFLPs, 47 RAPDs, 29 SSRs, five inter-SSRs, and two isozymes) and one morphological trait (carpel number) was constructed using the F2 progeny of a cross between the Korean accession P1161375 and the Spanish melon type 'Pinyonet Piel de Sapo'. RFLPs were obtained using 212 probes from different genomic and cDNA melon libraries, including 16 Arabidopsis ESTs, 13 Cucumis known genes, and three resistant gene homologues. Most loci (391) mapped to 12 major linkage groups, spanning a total genetic distance of 1197 cM, with an average map interval of 3 cM/marker. The remaining 21 loci (six RAPDs and 15 AFLPs) were not linked. A majority (66%) of the markers were codominant (RFLPs, SSRs, and isozymes), making them easily transferable to other melon crosses. Such markers can be used as a reference, to merge other melon and cucumber maps already constructed. Indeed, some of them (23 SSRs, 14 RFLPs, one isozyme, and one morphological trait) could act as anchor points with other published cucurbit maps.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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