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Enregistrement W2167541721 · doi:10.1093/ndt/gfl619

Uraemic plasma decreases the expression of ABCA1, ABCG1 and cell-cycle genes in human coronary arterial endothelial cells

2006· article· en· W2167541721 sur OpenAlexaff
Héloïse Cardinal, M.-A. Raymond, Marie‐Josée Hébert, F. Madore

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueKruppel-like factors research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene expressionInternal medicineEndocrinologyEndothelial stem cellABCG1BiologyApoptosisMedicineMolecular biologyGeneABCA1Biochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Uraemia is associated with endothelial dysfunction, but the effect of uraemic plasma on the gene expression pattern of human coronary arterial endothelial cells (HCAEC) has never been defined. METHODS: HCAECs were exposed for 48 h to a culture medium supplemented with 20% uraemic vs normal plasma. We extracted mRNA and hybridized it onto Affymetrix HG-U133 Plus2 microarrays. We validated our findings for five genes of interest by real-time PCR and performed evaluations of cell proliferation and apoptosis in HCAECs exposed to uraemic vs normal plasma. RESULTS: Six genes involved in the regulation of cell-cycle progression (CDK-1, topoisomerase II, PDZ-binding kinase, CDCA1, protein SDP35, E2F transcription factor 8) and two genes of the cholesterol efflux system (ABCA1 and ABCG1) were down-regulated in HCAECs exposed to uraemic plasma (>1.75-fold change vs normal). Real-time PCR confirmed the down-regulation observed in the microarray experiment. Cell proliferation was significantly decreased in HCAECs exposed to uraemic vs normal plasma for 48 h (86 vs 95% of serum-starved control, P = 0.006). Exposure to uraemic plasma for 48 h was associated with increased apoptosis of HCAEC as compared with normal plasma (7.7 vs 2.8%, P < 0.001), a phenomenon that was further enhanced when oxidized LDLs (150 microg protein/ml) were added to the medium containing uraemic plasma (16.9 vs 7.7%, P < 0.001). CONCLUSIONS: The down-regulation of genes involved in cell-cycle progression and cholesterol efflux from HCAECs exposed to uraemic conditions could contribute to enhancing endothelial dysfunction and atherosclerosis in patients with chronic renal failure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,491

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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