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Enregistrement W2167564024 · doi:10.1139/z09-115

Population genetic structure of long-tailed pygmy rice rats (Oligoryzomys longicaudatus) from Argentina and Chile based on the mitochondrial control region

2010· article· en· W2167564024 sur OpenAlexvenueno aff
Raúl E. González‐Ittig, Hernán J. Rossi-Fraire, Gustavo Cantoni, Eduardo Herrero, Rosendo Benedetti, Milton H. Gallardo, Cristina N. Gardenal

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAnimal Ecology and Behavior Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Mots-clésRefugium (fishkeeping)BiologyGene flowCricetidaeEcologyRange (aeronautics)PopulationmtDNA control regionHaplotypeGenetic structurePhylogeographyZoologyPhylogenetic treeGenetic variationGeneticsDemographyAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rodent Oligoryzomys longicaudatus (Bennett, 1832) (Rodentia, Cricetidae) inhabits southern forests of Argentina and Chile, a region severely affected by glaciations during the Pleistocene–Holocene periods. We evaluate here the diversity of the mitochondrial control region to characterize the genetic structure of this species from forests and bushy areas of seven populations from Argentina and four populations from Chile. Statistical analyses showed shallow haplotype trees and mismatch distributions compatible with recent range expansions. The presence of “private” haplotypes indicates that current levels of gene flow among populations of each country would be low to moderate. Significant differences in haplotype frequencies were detected between eastern and western populations, indicating that the Andes mountains would be an effective geographic barrier for gene flow despite the existing valleys that could act as corridors for dispersion. A single clade containing all the haplotypes was recovered in the phylogenetic trees, suggesting postglacial dispersion from a single refugium during the Last Glacial Maximum. The higher effective size and levels of polymorphism in populations from Chile suggest that the refugium was located in this country. The asymmetric gene flow from Chile to Argentina may reflect a recent colonization of the eastern populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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