Population genetic structure of long-tailed pygmy rice rats (Oligoryzomys longicaudatus) from Argentina and Chile based on the mitochondrial control region
Notice bibliographique
Résumé
The rodent Oligoryzomys longicaudatus (Bennett, 1832) (Rodentia, Cricetidae) inhabits southern forests of Argentina and Chile, a region severely affected by glaciations during the Pleistocene–Holocene periods. We evaluate here the diversity of the mitochondrial control region to characterize the genetic structure of this species from forests and bushy areas of seven populations from Argentina and four populations from Chile. Statistical analyses showed shallow haplotype trees and mismatch distributions compatible with recent range expansions. The presence of “private” haplotypes indicates that current levels of gene flow among populations of each country would be low to moderate. Significant differences in haplotype frequencies were detected between eastern and western populations, indicating that the Andes mountains would be an effective geographic barrier for gene flow despite the existing valleys that could act as corridors for dispersion. A single clade containing all the haplotypes was recovered in the phylogenetic trees, suggesting postglacial dispersion from a single refugium during the Last Glacial Maximum. The higher effective size and levels of polymorphism in populations from Chile suggest that the refugium was located in this country. The asymmetric gene flow from Chile to Argentina may reflect a recent colonization of the eastern populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».