Structure-Function Relationships in Hydrophobins: Probing the Role of Charged Side Chains
Notice bibliographique
Résumé
Hydrophobins are small fungal proteins that are amphiphilic and have a strong tendency to assemble at interfaces. By taking advantage of this property, hydrophobins have been used for a number of applications: as affinity tags in protein purification, for protein immobilization, such as in foam stabilizers, and as dispersion agents for insoluble drug molecules. Here, we used site-directed mutagenesis to gain an understanding of the molecular basis of their properties. We especially focused on the role of charged amino acids in the structure of hydrophobins. For this purpose, fusion proteins consisting of Trichoderma reesei hydrophobin I (HFBI) and the green fluorescent protein (GFP) that contained various combinations of substitutions of charged amino acids (D30, K32, D40, D43, R45, K50) in the HFBI structure were produced. The effects of the introduced mutations on binding, oligomerization, and partitioning were characterized in an aqueous two-phase system. It was found that some substitutions caused better surface binding and reduced oligomerization, while some showed the opposite effects. However, all mutations decreased partitioning in surfactant systems, indicating that the different functions are not directly correlated and that partitioning is dependent on finely tuned properties of hydrophobins. This work shows that not all functions in self-assembly are connected in a predictable way and that a simple surfactant model for hydrophobin function is insufficient.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».