The cytoplasmic domain is critical to the tumor suppressor activity of TSLC1 in non-small cell lung cancer.
Notice bibliographique
Résumé
The tumor suppressor gene in lung cancer (TSLC1) encodes a membrane glycoprotein containing extensive homology in the extracellular domain with the immunoglobulin-superfamily cell adhesion molecules. The intracellular cytoplasmic domain (CT) contains a protein 4.1 (FERM) binding motif, and a PDZ-interacting motif. Expression of TSLC1 is silenced in non-small cell lung cancer and in other cancers by promoter hypermethylation. Restoration of TSLC1 expression suppresses tumorigenicity of lung cancer cells. We report here the critical role of the FERM-binding and PDZ- interacting domains of TSLC1 in tumor suppressor activity in non-small cell lung cancer. The entire CT domain [amino acid (aa) 398-442], the FERM binding motif (aa 398-410), or the PDZ-interacting motif (aa 432-442) was deleted to generate mutants CT1, CT3, and CT4, respectively. The lung cancer cell line A549, deficient in TSLC1 expression, was stably transfected with the wild-type TSLC1 or the deletion mutants. The cell lines were then injected into athymic (nu/nu) nude mice, and tumor formation at the sites of injection was monitored. A549 cells stably transfected with the empty vector or mutant TSLC1 constructs induced tumors at the sites of injection within 10 days. In contrast, A549 cells expressing wild-type TSLC1 showed the appearance of tumors after 35 days, and the tumors grew substantially slower. A549 cells expressing wild-type TSLC1 also showed suppression of anchorage-independent colony formation in soft agar and markedly increased cell-cell adhesion activity. These results suggest that the cytoplasmic domain of TSLC1 is important in its tumor suppressor activity, and the tumor suppression activity involve protein(s) interacting with the FERM- and PDZ-interacting regions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».