Metalloprotease Vsm Is the Major Determinant of Toxicity for Extracellular Products of<i>Vibrio splendidus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Genomic data combined with reverse genetic approaches have contributed to the characterization of major virulence factors of Vibrio species; however, these studies have targeted primarily human pathogens. Here, we investigate virulence factors in the oyster pathogen Vibrio splendidus LGP32 and show that toxicity is correlated to the presence of a metalloprotease and its corresponding vsm gene. Comparative genomics showed that an avirulent strain closely related to LGP32 lacked the metalloprotease. The toxicity of LGP32 metalloprotease was confirmed by exposing mollusk and mouse fibroblastic cell lines to extracellular products (ECPs) of the wild type (wt) and a vsm deletion mutant (Deltavsm mutant). The ECPs of the wt induced a strong cytopathic effect whose severity was cell type dependent, while those of the Deltavsm mutant were much less toxic, and exposure to purified protein demonstrated the direct toxicity of the Vsm metalloprotease. Finally, to investigate Vsm molecular targets, a proteomic analysis of the ECPs of both LGP32 and the Deltavsm mutant was performed, revealing a number of differentially expressed and/or processed proteins. One of these, the VSA1062 metalloprotease, was found to have significant identity to the immune inhibitor A precursor, a virulence factor of Bacillus thuringiensis. Deletion mutants corresponding to several of the major proteins were constructed by allelic exchange, and the ECPs of these mutants proved to be toxic to both cell cultures and animals. Taken together, these data demonstrate that Vsm is the major toxicity factor in the ECPs of V. splendidus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».