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Enregistrement W2167890002 · doi:10.1093/aob/mcr057

Analyses of two rice (Oryza sativa) cyclin-dependent kinase inhibitors and effects of transgenic expression of OsiICK6 on plant growth and development

2011· article· en· W2167890002 sur OpenAlexaff
Ruifang Yang, Qicai Tang, Huimei Wang, Xiaobo Zhang, Gang Pan, Hong Wang, Jumin Tu

Notice bibliographique

RevueAnnals of Botany · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCyclin-dependent kinaseArabidopsisOryza sativaFusion proteinCell biologyCyclinGreen fluorescent proteinTransgeneGeneticsMolecular biologyGeneRecombinant DNAMutantCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Plants have a family of proteins referred to as ICKs (inhibitors of cyclin-dependent kinase, CDK) or KRPs (Kip-related proteins) that function to regulate the activities of CDK. Knowledge of these plant CDK inhibitors has been gained mostly from studies of selected members in dicotyledonous plants, particularly Arabidopsis. Much remains to be learned regarding the differences among various members of the ICK/KRP family, and regarding the function and regulation of these proteins in monocotyledonous plants. METHODS: We analysed ICK-related sequences in the rice (Orysa sativa L. subsp. indica) genome and determined that there are six members with the conserved C-terminal signature region for ICK/KRP proteins. They are referred to as OsiICKs and further analyses were performed. The interactions with CDKs and cyclins were determined by a yeast two-hybrid assay, and cellular localization by fusion with the enhanced green fluorescence protein (EGFP). The expression of OsiICK6 in different tissues and in response to several treatments was analysed by reverse transcriptase-mediated polymerase chain reaction (RT-PCR) and real-time PCR. Furthermore, OsiICK6 was over-expressed in transgenic rice plants and significant phenotypes were observed. KEY RESULTS AND CONCLUSIONS: Based on putative protein sequences, the six OsiICKs are grouped into two classes, with OsiICK1 and OsiICK6 in each of the two classes, respectively. Results showed that OsiICK1 and OsiICK6 interacted with OsCYCD, but differed in their interactions with CDKA. Both EGFP:OsiICK1 and EGFP:OsiICK6 were localized in the nucleus. Whereas EGFP:OsiICK6 showed a punctuate subnuclear distribution, OsiICK1 had a homogeneous pattern. Over-expression of OsiICK6 resulted in multiple phenotypic effects on plant growth, morphology, pollen viability and seed setting. In OsiICK6-over-expressing plants, leaves rolled toward the abaxial side, suggesting that cell proliferation is critical in maintaining an even growth along the dorsal-ventral plane of leaf blades.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,578

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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