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Enregistrement W2167891910 · doi:10.1371/journal.pone.0039247

Polymorphisms in RYBP and AOAH Genes Are Associated with Chronic Rhinosinusitis in a Chinese Population: A Replication Study

2012· article· en· W2167891910 sur OpenAlexaffabout
Yuan Zhang, Léandra Mfuna Endam, Abdelali Filali‐Mouhim, Liping Zhao, Martin Desrosiers, Demin Han, Luo Zhang

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSinusitis and nasal conditions
Établissements canadiensMontreal General HospitalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Science Fund for Distinguished Young ScholarsBeijing Nova ProgramNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismNasal polypsInternational HapMap ProjectPopulationSNPGeneticsGenetic associationBiologyImmunologyGenotypeChronic rhinosinusitisMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The development of CRS is believed to be the result of combined interactions between the genetic background of the affected subject and environmental factors. OBJECTIVES: To replicate and extend our recent findings from genetic association studies in chronic rhinosinusitis (CRS) performed in a Canadian Caucasian population in a Chinese population. METHODS: In a case-control replication study, DNA samples were obtained from CRS with (n = 306; CRSwNP) and without (n = 332; CRSsNP) nasal polyps, and controls (n = 315) in a Chinese population. A total of forty-nine single nucleotide polymorphisms (SNPs) selected from previous identified SNPs associated with CRS in Canadian population, and SNPs from the CHB HapMap dataset were individually genotyped. RESULTS: We identified two SNPs respectively in RYBP (rs4532099, p = 2.15E-06, OR = 2.59) and AOAH (rs4504543, p = 0.0001152, OR = 0.58) significantly associated with whole CRS cohort. Subgroup analysis for the presence of nasal polyps (CRSwNP and CRSsNP) displayed significant association in CRSwNP cohorts regarding to one SNP in RYBP (P = 3.24(E)-006, OR = 2.76). Evidence of association in the CRSsNP groups in terms of 2 SNPs (AOAH_rs4504543 and RYBP_rs4532099) was detected as well. Stratifying analysis by gender demonstrated that none of the selected SNPs were associated with CRSwNP as well as CRSsNP. Meanwhile 3 SNPs (IL1A_rs17561, P = 0.005778; IL1A_rs1800587, P = 0.009561; IRAK4_rs4251513, P = 0.03837) were associated with serum total IgE level. CONCLUSIONS: These genes are biologically plausible, with roles in regulation of transcription (RYBP) and inflammatory response (AOAH). The present data suggests the potential common genetic basis in the development of CRS in Chinese and Caucasian population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,383

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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