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Enregistrement W2168051561 · doi:10.1021/jp0723665

Ab Initio Molecular Dynamics and Time-Resolved Photoelectron Spectroscopy of Electronically Excited Uracil and Thymine

2007· article· en· W2168051561 sur OpenAlexaff
Hanneli R. Hudock, Benjamin G. Levine, Alexis L. Thompson, Helmut Satzger, Dave Townsend, Niklas Gador, Susanne Ullrich, Albert Stolow, Todd J. Martı́nez

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensSteacie Institute for Molecular Sciences
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésConical intersectionExcited stateFemtosecondThyminePicosecondUracilChemistrySpectroscopyAb initioAtomic physicsAb initio quantum chemistry methodsElectronic structurePotential energy surfaceTime-resolved spectroscopyMolecular physicsPhysicsComputational chemistryDNAMoleculeOpticsQuantum mechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The reaction dynamics of excited electronic states in nucleic acid bases is a key process in DNA photodamage. Recent ultrafast spectroscopy experiments have shown multicomponent decays of excited uracil and thymine, tentatively assigned to nonadiabatic transitions involving multiple electronic states. Using both quantum chemistry and first principles quantum molecular dynamics methods we show that a true minimum on the bright S2 electronic state is responsible for the first step that occurs on a femtosecond time scale. Thus the observed femtosecond decay does not correspond to surface crossing as previously thought. We suggest that subsequent barrier crossing to the minimal energy S2/S1 conical intersection is responsible for the picosecond decay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations387
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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