MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2168086335 · doi:10.4049/jimmunol.1201751

Tissue-Specific Host Recognition by Complement Factor H Is Mediated by Differential Activities of Its Glycosaminoglycan-Binding Regions

2013· article· en· W2168086335 sur OpenAlexaff
Simon J. Clark, Liam A. Ridge, Andrew P. Herbert, Svetlana Hakobyan, Barbara Mulloy, Rachel Lennon, Reinhard Würzner, B. Paul Morgan, Dušan Uhrı́n, Anthony J. Day

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilManchester Biomedical Research CentreUniversity of OxfordMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchWellcome Trust
Mots-clésGlycosaminoglycanComplement (music)Host (biology)Factor HHost factorsDifferential (mechanical device)Factor (programming language)Complement factor ICell biologyComplement systemImmunologyBiologyChemistryBiochemistryComputer scienceAntibodyGeneticsGenePhenotypePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Complement factor H (CFH) regulates complement activation in host tissues through its recognition of polyanions, which mediate CFH binding to host cell surfaces and extracellular matrix, promoting the deactivation of deposited C3b. These polyanions include heparan sulfate (HS), a glycosaminoglycan with a highly diverse range of structures, for which two regions of CFH (CCP6-8 and CCP19-20) have been implicated in HS binding. Mutations/polymorphisms within these glycosaminoglycan-binding sites have been associated with age-related macular degeneration (AMD) and atypical hemolytic uremic syndrome. In this study, we demonstrate that CFH has tissue-specific binding properties mediated through its two HS-binding regions. Our data show that the CCP6-8 region of CFH binds more strongly to heparin (a highly sulfated form of HS) than CCP19-20, and that their sulfate specificities are different. Furthermore, the HS binding site in CCP6-8, which is affected by the AMD-associated Y402H polymorphism, plays the principal role in host tissue recognition in the human eye, whereas the CCP19-20 region makes the major contribution to the binding of CFH in the human kidney. This helps provide a biochemical explanation for the genetic basis of tissue-specific diseases such as AMD and atypical hemolytic uremic syndrome, and leads to a better understanding of the pathogenic mechanisms for these diseases of complement dysregulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations148
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of ImmunologyMême sujetComplement system in diseasesTravaux en français237 207